Prvo spominjanje Bajkalskog jezera u istoriji datira iz 110. pne. Kinezi su potomcima u pisanim dokumentima prepustili informacije o "Sjevernom jezeru", jezeru Beihai. Početkom naše ere procvjetala je kultura Kurumchin, koja je dugo živjela oko Bajkalskog jezera. U X-XVI vijeku zamijenjena su plemena Kurykan, Khori i Tungus. U XVII-VIII vijeku. teritoriju oko jezera naseljavaju burjatska plemena. Ruski kozaci dosegli su Bajkal u 17. veku.
Kozaci pioniri
Prvi podaci o Burjatima datiraju iz 1609. godine. Početkom 17. vijeka ovaj se region aktivno razvija. Osnivanje Tomska datira iz 1604. godine, izgradnja zatvora Jenisej - 1619. godine, zatvora u Krasnojarsku - 1628. godine. Pioniri su napredovali duž Verkhnyaya Tunguske, Angare, Lene. U 1640.-1641., Baikal se spominje u "Crtačkoj slici" koja opisuje pritoke rijeke Lene. Pozivajući se na Burjate, naznačeno je: "… bratski ljudi zovu Bajkalsko jezero". Naznačeno je da su u leto 1640. godine kozaci plovili duž Bajkala, opisano je samo jezero, deo obale i ostrvo Olkhon. Djelomično opisane životinje, stanovnici obale, njihov način života.
Neki istraživači spominju Ivana Galkina, poglavicu, koji se popeo na rijeku Angaru sa odredom od 30 kozaka, koji su 1631. godine postavili zimovnik u blizini rijeke Igirme. Međutim, većina istoričara izlazak na Bajkalsko jezero povezuje s imenom Kurbat Ivanov. 1643. njegov odred prešao je greben Primorsky i duž rijeke Sarme, kroz Stepu Kosaya, stigao do Bajkalskog jezera na mjestu nasuprot ostrva Olkhon.
Kurbat Ivanov je sastavio poruku guverneru Petru Golovinu u zatvoru Jakutsk o bogatim zemljama oko jezera. Ime "Baigaal", koje je došlo iz burjatskog jezika, promijenjeno je u prikladnije za ruski jezik "Baikal". Upravo je Ivanov izradio prvi crtež jezera, prikupljajući informacije o ribama koje se nalaze u Bajkalskom jezeru, o vrstama krznenih životinja na njegovim obalama.
Vođena dobivenim informacijama, vlada je 1644. poslala Kozake na jezero pod vodstvom Vasilija Kolesnikova. Ovaj se odred vraćao iz Jenisejska nakon potrage za nalazištima ruda srebra. Vasilij Kolesnikov pružio je drugu kartu jezera. Ivan Pokhabov 1647. godine, na putu za Mongoliju, prešao je led preko južnog Bajkala. Izgrađene su utvrde Barguzinsky i Ust-Barguzinsky.
Opis južnog dela Bajkala dat je u službenom pismu bojarinog sina Pjotra Beketova, datiranom 1653. godine i upućenom jenizejskom guverneru Afanasiju Puškovu. Peter Beketov prešao je udaljenost od Yeniseiska do zatvora Bratsk, kroz ušće Prorva, duž Baikala do Selenge, plovio rijekama Selenga i Khilka.
Zanimljive činjenice o otkriću i proučavanju Bajkala
U "Slikanju imena", prema kojem je car yasak išao u jenizejski zatvor, Bajkal se naziva morem.
Prvi književni opis Bajkalskog jezera dao je protojerej Avvakum u knjizi "Život protojereja Avvakuma", koji je posetio Bajkalsko jezero na putu u izgnanstvo 1665. godine. U knjizi je starovjernik živopisno opisao prirodu jezera.
1667. godine na "Crtežu sibirske zemlje" daje se potpuna slika Bajkalskog jezera, sastavljena ukazom Perta Ivanoviča Godunova, guvernera Tobolska.
Prvi znanstvenik kojeg je Petar I poslao u Bajkal da proučava Sibir bio je D. G. Messerschmidt.
Prvo instrumentalno istraživanje i detaljnu kartu Bajkalskog jezera sa deset versta sastavio je navigator Aleksej Puškarev.
Prirodu i faunu Bajkalskog regiona proučavali su akademici I. G. Gmelin 1732-1748, akademik P. S. Pallas 1771-1773, akademik I. G. Georgi.